L’economia del sistema UV està determinada pels següents factors: cost i vida útil de l’equip; eficiència elèctrica; grau de reducció de l'efecte d'esterilització durant l'operació; costos d’electricitat, etc. L’anàlisi econòmica del sistema de desinfecció ultraviolada encara no ha arribat a una conclusió. Hi ha molts informes d’anàlisi amb conclusions diferents. Hi ha opinions que el dispositiu de desinfecció ultraviolada consumeix molta electricitat i el manteniment i el cost de l’equip són elevats. Per a sistemes grans, la inversió en equips és superior a la del sistema d’ozó i el cost operatiu és similar al de l’ozó; però, per al petit sistema de producció d’aigua pura, la inversió és inferior a la del dispositiu d’ozó. També hi ha opinions que per a escales de tractament de milers de tones / dia o més, els costos d’inversió i d’explotació del sistema de desinfecció UV són molt avantatjosos, molt inferiors al cost de la cloració i la desinfecció de l’ozó. Per exemple, hi ha informes de dades analítiques que quan construeixen una petita planta de tractament d’aigua potable amb una població que oscil·la entre els 10 i els 25.000 habitants, la relació aproximada dels costos de desinfecció ultraviolada, diòxid de clor i ozó és d’1: 4: una població superior a Per a 500.000 organitzacions socials, la relació de costos és d’1: 2,5: 2,5.
Aquestes estimacions de costos no inclouen el cost addicional d’eliminar els subproductes de desinfecció i els quists de cryptosporidium quan s’utilitzen processos de desinfecció no UV. A més, les dades de l’anàlisi mostren que els costos d’inversió i d’explotació de la desinfecció ultraviolada són inferiors als de la desinfecció amb clor i que el cost de desinfecció és aproximadament la meitat del clor, però la diferència es redueix amb l’ampliació de l’escala de tractament de l’aigua.
A França i l’antiga Unió Soviètica, la desinfecció ultraviolada es limitava a equips petits. El gran equipament establert va ser instal·lar làmpades ultraviolades en sèrie a la xarxa d’aigua filtrada. Als Estats Units, la desinfecció ultraviolada també es limita a equips petits i piscines, i sovint es combina amb altres desinfectants. No obstant això, s'ha informat en aplicacions pràctiques que l'escala de les plantes d'aigua potable que utilitzen la desinfecció ultraviolada ha superat els 1,5 milions de tones diàries.